這波新流感疫情影響有多大？中研院院士陳建仁推估，國內恐有七千人死亡，前疾管局長蘇益仁認為，死亡人數約在五千到一萬人之間，若防疫措施沒做好，可能會更多。
隨各國採取防疫措施不同，新流感死亡率約在千分之二至千分之四。陳建仁保守估計，這波新流感疫情，約三分之一可能遭感染，以死亡率千分之一計，國內約七千人可能喪命。
至於每年流行的季節性流感，死亡率低於千分之一，併發重症及其他感染而死者，每年大約兩千到三千人，且絕大部分都是六十五歲以上老人跟小孩。陳建仁說：「新流感不一樣，大多數死亡的會是青壯年，衝擊更大」。
蘇益仁以介於美國、日本感染率及死亡率的中間模式估算，國內死亡人數恐介於五千到一萬人之間。他預估，開學後疫情會明顯走揚，十、十一月達到高峰。
他也提醒，今年冬天縣市長選舉，候選人場子上人口大量聚集，可能增加傳播速度。他甚至建議，應視疫情考慮選舉暫緩。
但防疫措施做得好，能有效降低死亡人數。陳建仁說，若以每周感染人數一萬人、每周感染人數呈倍數成長，到了十一月初，感染人數多達一千萬人，但若介入措施得當，可控制病患增加速度。
究竟新流感疫情何時能結束？陳建仁也無法預測。「若疫情壓不下來，半年內就能結束；疫情控制得好，反而可能會延緩傳播速度，流行兩、三年。」但短期內大量流行絕非好事，陳建仁說，因為短期間內病患驟增，醫療院所將根本無力負荷。
目前群聚感染時，有症狀者全部給予克流感，透過藥物等措施，疫情雖會久拖，死亡率會明顯降低。寬鬆的給藥政策就是為了延緩傳播速度。
